Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPPED1Q9BRF8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPPED1Q9BRF8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms