Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOPXQ9BPY8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOPXQ9BPY8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOPXQ9BPY8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOPXQ9BPY8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOPXQ9BPY8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOPXQ9BPY8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms