Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3AQ99856 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ARID3AQ99856 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms