Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPAS2Q99743 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPAS2Q99743 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms