Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD9AQ99638 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD9AQ99638 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD9AQ99638 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms