Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPS8Q99627 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS8Q99627 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS8Q99627 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms