Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKP4Q99569 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKP4Q99569 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms