Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP19Q99542 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP19Q99542 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP19Q99542 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms