Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCCC1Q96RQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC1Q96RQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCC1Q96RQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms