Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CITED4Q96RK1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED4Q96RK1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED4Q96RK1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms