Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLC4A9Q96Q91 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLC4A9Q96Q91 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SLC4A9Q96Q91 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLC4A9Q96Q91 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms