Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC9Q96Q05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC9Q96Q05 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC9Q96Q05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms