Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF3Q96PU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF3Q96PU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms