Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP3Q96P47 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms