Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP57Q96MR6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP57Q96MR6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms