Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF488Q96MN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF488Q96MN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF488Q96MN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms