Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AGBL1Q96MI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AGBL1Q96MI9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGBL1Q96MI9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms