Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PCMTD1Q96MG8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCMTD1Q96MG8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.3 ms