Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSMCE3Q96MG7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMCE3Q96MG7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms