Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARK4Q96L34 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARK4Q96L34 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK4Q96L34 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK4Q96L34 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARK4Q96L34 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms