Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNIP3Q96KP6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNIP3Q96KP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms