Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJD4Q96KN9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJD4Q96KN9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GJD4Q96KN9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms