Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMX3Q96JJ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMX3Q96JJ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms