Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSL1Q96IY1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSL1Q96IY1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms