Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC22AQ96IW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC22AQ96IW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEC22AQ96IW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms