Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM46AQ96IP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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FAM46AQ96IP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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FAM46AQ96IP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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FAM46AQ96IP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM46AQ96IP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM46AQ96IP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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