Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGSM3Q96HU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGSM3Q96HU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms