Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CENPNQ96H22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPNQ96H22 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms