Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APIPQ96GX9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APIPQ96GX9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms