Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BORCS6Q96GS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BORCS6Q96GS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms