Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCMH1Q96GD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCMH1Q96GD3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCMH1Q96GD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms