Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIPA1Q96FS4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIPA1Q96FS4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIPA1Q96FS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIPA1Q96FS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms