Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEIL1Q96FI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEIL1Q96FI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEIL1Q96FI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms