Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNRIP1Q96F85 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNRIP1Q96F85 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms