Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL53Q96EL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL53Q96EL3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL53Q96EL3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms