Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAF2Q96CS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAF2Q96CS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAF2Q96CS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms