Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF653Q96CK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF653Q96CK0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms