Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIGD2Q96BF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD2Q96BF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms