Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7BQ96AH8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB7BQ96AH8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB7BQ96AH8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms