Protein–RNA interactions for Protein: Q96A44

SPSB4, SPRY domain-containing SOCS box protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB4Q96A44 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPSB4Q96A44 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPSB4Q96A44 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPSB4Q96A44 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms