Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAVIN3Q969G5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAVIN3Q969G5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAVIN3Q969G5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms