Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXJ1Q92949 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXJ1Q92949 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXJ1Q92949 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms