Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAD50Q92878 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms