Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXB13Q92826 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB13Q92826 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB13Q92826 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms