Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRUQ92729 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRUQ92729 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRUQ92729 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRUQ92729 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRUQ92729 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PTPRUQ92729 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRUQ92729 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRUQ92729 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRUQ92729 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRUQ92729 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRUQ92729 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms