Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RGP1Q92546 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RGP1Q92546 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms