Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPDL3BQ92485 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPDL3BQ92485 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms