Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC12Q8WUD4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC12Q8WUD4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC12Q8WUD4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms