Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE22Q8NFJ8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHLHE22Q8NFJ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms