Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID1BQ8NFD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID1BQ8NFD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.1 ms